Biomedical Data Scientist (NLP expert)

RAPID is een onderzoeksgroep die zich richt op de beoordeling van gezondheidsrisico’s van producten in ontwikkeling. RAPID bestudeert de effecten van mogelijke blootstellingen aan gevaarlijke stoffen uit verschillende bronnen en omgevingen, zoals werkplekken, algemene omgeving en voedsel of medicijnen. RAPID heeft ongeveer 50 wetenschappers in dienst met expertise in diverse gebieden, zoals toxicologie, epidemiologie, blootstellingsleer, chemie, arbeidshygiëne en statistiek.

Deze wetenschappers gebruiken risicoanalyse, statistische expertise en experimenteel onderzoek om innovatieve, wetenschappelijk onderbouwde instrumenten, modellen en methoden te ontwikkelen om de risico’s te voorspellen en te verminderen. Het doel van RAPID is om de gezondheid van de mensen te verbeteren door het verminderen van de blootstelling aan gevaarlijke stoffen. Ze doen dit door actief bij te dragen aan activiteiten zoals het adviseren over preventieve maatregelen, het toepassen van veilige en duurzame ontwerpprincipes voor producten en processen, en het leveren van bruikbare kennis voor beleidsmakers en andere belanghebbenden. RAPID werkt samen met universiteiten, onderzoeksinstituten, overheden en industriële partners.

Een van de onderzoekslijnen binnen de afdeling RAPID is gericht op de ontwikkeling van innovatieve oplossingen op basis van tekst- en datamining ter ondersteuning van biomedisch onderzoek. Voorbeelden hiervan zijn de ontwikkeling van het webgebaseerde platform TargetTri ter ondersteuning van drug target profiling, de toepassing van Large Language Models (LLM's) om data-gedreven target identificatie en training uit te voeren en het toepassen van LLM's ter ondersteuning van de ontwikkeling van proefdiervrije methodologieën en het analyseren van hun translationele waarde.

Als text-miningexpert werk je samen met een team van ontwikkelaars en biomedische experts, afhankelijk van het project. Je maakt ook deel uit van een afdelingsoverschrijdend team van datawetenschappers.
#LI-Hybrid
We zijn op zoek naar een ervaren Biomedical Data Scientist (NLP expert) met een gedegen kennis van het biomedische domein om ons team te versterken. Je kernactiviteiten zijn:

• Ontwikkelen en toepassen van NLP-modellen ter ondersteuning van verschillende aspecten van biomedische resultaten;
• Creatie en curatie van trainings- en testsets die nodig zijn voor de ontwikkeling van nieuwe NLP-modellen;
• Bepalen van relevantie en bruikbaarheid van bestaande LLM's voor specifieke onderzoeksvragen;
• Brede kijk op NLP en het vermogen om te adviseren over de geschiktheid van text-mining methoden;
• Relevante informatie extraheren uit openbare databases en andere bronnen volgens interne normen voor gegevensverwerking;
• Samenstellen en communiceren van onderzoeksresultaten in wetenschappelijke publicaties, presentaties van wetenschappelijke congressen en interne TNO-rapporten;
• Participeren in (multidisciplinaire) onderzoeksprojecten en in wetenschappelijke discussies met (internationale) experts uit diverse vakgebieden zowel binnen TNO als in (inter)nationale projecten;
• Deelnemen aan het schrijven van interne en externe projectvoorstellen voor onderzoek.

We zijn op zoek naar een enthousiaste en proactieve teamspeler met wetenschappelijke interesse in het toepassen van tekst- en dataminingcapaciteiten in het biomedische en gezondheidsdomein.Je bent data-georiënteerd en comfortabel met programmeren, data-analyse en NLP. Je bent niet alleen enthousiast om nieuwe methodologieën te verkennen, maar ook gedreven om deze methodologieën te implementeren in toepassingen die door anderen kunnen worden gebruikt. Je gebruikt je biomedische kennis om het ontwerp van onze text-mining oplossingen te sturen en te optimaliseren.

We zoeken een Biomedical Data Scientist (NLP expert) met:

• Ervaring op het gebied van biomedische wetenschappen, bijv. farmaceutische wetenschap, ontdekking van geneesmiddelen;
• Ervaring met NLP-tools zoals NLTK, SpaCy en HuggingFace;
• Ervaring met het analyseren van ongestructureerde tekstuele datasets en toepassing van text-miningtechnieken (bijv. Named Entity Extraction, Relation Extraction, Text Classification, enz.);
• Ervaring met andere soorten (big) data-analyses (bijv.: bouwen van kennisgrafieken);
• Sterke vaardigheden en ervaring in relevante programmeertalen (Python);
• Passie voor NLP en willen dat je werk een grote impact heeft op gezondheid in praktische toepassingen;
• Uitstekende mondelinge en schriftelijke communicatieve vaardigheden in het Engels;
• Ervaring met werken in projectteams;
• Beschikbaarheid van 32-40 uur per week.

Uitdagend én afwisselend werk met serieuze impact. En volop kansen, want bij TNO heb je grotendeels zelf de regie over je carrière. Naast een bruto (fulltime) maandsalaris tussen € 3.950,- en € 6.500,- (afhankelijk van je kennis en ervaring), vakantiegeld (8%), een dertiende maand (8,33%) en een flexbudget (5,58% + €180), krijg je alle mogelijkheden om jezelf te ontwikkelen.

Daarnaast kun je bij TNO een ‘menu’ aan arbeidsvoorwaarden samenstellen dat bij jouw persoonlijke situatie past. Wat je ook mag verwachten:

• Een uiterst professionele, innovatieve werkomgeving, met topexperts als collega’s.
• Mogelijkheid om cursussen, opleidingen en workshops te volgen en congressen te bezoeken, en coaching als je daar behoefte aan hebt.
• 33 vakantiedagen (bij een fulltime dienstverband).
• Een werkgever die divers talent waardeert en stimuleert, met initiatieven als het Female Leadership Programma, onze Rainbow Community en round tables over inclusiethema’s.
• Een uitgebreide en flexibele mobiliteitsregeling, inclusief volledige vergoeding van openbaar vervoer voor woon-werk en zakelijke reizen.
• Gezellige activiteiten met je team en andere TNO'ers. Zo leer je snel veel mensen kennen.
• Flexibele werktijden, de mogelijkheid om parttime (32 of 36 uur) te werken en de mogelijkheid om thuis te werken.
• Uitgebreid verhuispakket voor internationale sollicitanten.
• Een goede pensioenregeling.

Lees hier uit welke arbeidsvoorwaarden je verder kunt kiezen.

Bij TNO innoveren we voor een gezonder, veiliger en duurzamer leven. En voor een sterke economie. Sinds 1932 ontwikkelen wij kennis en technologie voor het algemeen belang. We vinden elkaar in verwondering en vindingrijkheid, en we zijn gedreven om grenzen te verleggen. Voor jouw talent en ambitie is er alle ruimte en ondersteuning. Je werkt samen met mensen die aan je gewaagd zijn, die jou inspireren én van jou willen leren. Onze state-of-the-art-faciliteiten zijn er om jouw visie te verwezenlijken. Wat je bij TNO doet, doet ertoe: impact maakt het verschil. Want met elke innovatie draag je bij aan het leven van morgen. Lees meer over TNO als werkgever.

Bij TNO stimuleren we een inclusieve werkomgeving, waar jij jezelf kunt zijn. Wat je verhaal ook is en welke unieke eigenschappen je ook meebrengt. Juist door onze unieke krachten en perspectieven te bundelen zijn we in staat om innovaties te ontwikkelen die een wezenlijk verschil maken in de samenleving. Meer weten? Lees welke stappen wij zetten op het gebied van diversiteit en inclusie.

Reageren kan tot en met 19 mei 2024. De sollicitatieprocedure bestaat uit twee gespreksrondes. In een laatste gesprek bespreken we de arbeidsvoorwaarden die je zelf samenstelt. We streven ernaar de hele procedure binnen vier weken af te ronden.

Een online assessment en referentiecheck kunnen onderdeel uitmaken van de selectieprocedure.

Als je bij ons komt werken vragen wij je ook een Verklaring Omtrent het Gedrag (VOG) te overleggen.